"Das Geheimnis der zählenden Eichhörnchen" erzählt die Geschichte von Fips, einem besonderen Eichhörnchen, das als Einziges im Wald zählen kann. Die anderen Waldtiere, wie Fips' beste Freundin Polly und Onkel Nuschel, können nur schätzen. Fips lernt die Bedeutung des Zählens, als der alte Uhu Professor Federweis ihm die Aufgabe gibt, die Wintervorräte zu ordnen und zu zählen.
Fips beginnt, Haselnüsse einzeln zu zählen und merkt schnell, dass er kleine Mengen auch auf einen Blick erfassen kann. Nach erfolgreichem Zählen von 37 Nüssen stellt ihm Professor Federweis eine weitere Herausforderung vor: das Verständnis von Mengen. Fips lernt daraufhin das Addieren und Subtrahieren anhand von Eicheln. Er versteht, dass Addieren das Zusammenlegen von Mengen und Subtrahieren das Wegnehmen von Mengen bedeutet.
Fips ist begeistert von seinen neuen Fähigkeiten, die ihm helfen werden, die Wintervorräte zu meistern, und freut sich darauf, sein Wissen mit Polly und Onkel Nuschel zu teilen.